哺乳动物的昼夜节律是基因编码的分子钟在体内产生的一种以大约24 h为周期的生理现象，使机体的生理过程与外界环境的变化相协调，是对环境适应的一种表现。在哺乳动物中，繁殖生理功能受生物钟系统的调节。在下丘脑-垂体-卵巢（hypothalamic-pituitary-ovarian，HPO）轴的各组织中均已观察到生物钟基因的表达，各层次的生物钟相互协调和同步，维持正常的生殖行为。昼夜节律的产生、维持和调控依赖连锁的转录-翻译反馈环路（transcription–translation feedback loop，TTLs），它决定着下丘脑-垂体-卵巢（hypothalamic-pituitary-ovarian，HPO）轴每个组织中基因表达的周期和振幅。卵巢中生物钟接受下丘脑视交叉上核的神经内分泌调控，但其又具有自主性。环境因素引起的生物钟紊乱会严重损害雌性动物的生殖能力，导致一系列相关的卵巢疾病。另外，生物钟还与卵巢衰老密切相关。基于已有的研究，本文着重阐述卵巢生物钟在卵泡发育、排卵和类固醇生成的作用机制，以及生物钟与卵巢衰老的最新研究进展。还介绍了几种常见的由生物钟紊乱引起的生殖能力下降的卵巢疾病。