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本研究采用ISSR分子标记对菊科各属种质进行遗传多样性和亲缘关系进行分析，为种质资源的有效保存及分子鉴定奠定基础。采用ISSR-PCR扩增国家中药种质资源库保存的菊科40个属的40份药用植物，琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物，NTSYS-pc2.1软件对电泳结果进行多态性分析，UPGMA构建遗传树。此次实验筛选出8条引物，40份材料扩增出68个位点，多态性位点为68个，多态性位点百分率为100%，遗传相似性系数范围在0.71~0.91。UPGMA聚类分析结果表明在相似性系数为0.75时可将这40种菊科药用植物