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借助三阶段DEA模型对重庆市制造业R＆D效率进行研究,在控制人力资本等环境因素的基础上对重庆市R＆D效率进行测度和分析。研究发现人力资本增加有利于提高新产品开发经费存量的利用效率,但会导致R＆D人力投入与R＆D经费利用效率下降。剔除环境与随机因素后,R＆D效率整体呈现下降趋势,纯技术效率过低是综合技术效率低下的主要原因。调整后的R＆D效率值表现出较大行业差异,更能反映真实的R＆D效率。各行业应充分考虑环境因素以及自身R＆D特征以提升相应效率水平。