目的分析胃肠镜检查护理的风险管理在临床治疗中的应用价值。方法抽取2015年8月-2016年8月(风险管理前)在医院进行胃肠镜检查的1 000例患者与2016年9月-2017年9月(风险管理后)进行胃肠镜检查的1 000例患者进行试验研究。风险管理前,外来胃肠镜进行常规终末消毒;风险管理后,外来胃肠镜进行常规清洗+2%戊二醛消毒10 h。结果风险管理后的临床肠胃镜检查后发生呼吸系统不良反应、消化系统不良反应以及循环系统不良反应的比率均有所降低,其中呼吸系统不良反应和循环系统不良反应发生率管理前后比较差异均有统计学意义(P<0.05)。在进行风险管理前,医院46条外来胃肠镜在清洗消毒后的微生物检测合格率为84.8%(39/46),而进行风险管理后外来胃肠镜在清洗消毒后的微生物检测合格率为100.0%(46/46),差异有统计意义(P<0.05)。结论外来镜消毒按常规清洗管理+2%戊二醛浸泡消毒10 h,可减少外来镜带来的风险,值得在胃肠临床治疗中推广。