大肠杆菌O85 O-抗原基因簇序列破译和特异分子标识的筛选

来源 :中国人兽共患病学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaoxz
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目的测定大测肝菌O85的O-抗原基因簇的序列.对其基因进行功能和进化的分析,筛选并鉴定可用于快速分子分型的特异分子标识。方法利用鸟枪法对大肠杆菌O85的O-抗原基因簇进行测序,生物信息学方法进行序列拼接与分析,确定针对大肠杆菌O85的特异基因并设计引物,PCR方法进行模拟环境样品的检测。结果大肠杆菌O85的O-抗原基因簇序列全长为11203bp。发现8个开放阅读框架(orf)并确定功能,分别为:UDP-N-乙酰葡萄糖-2-异构酶基因(orf1),吡嘀型UDP-半乳糖交位酶基因(glf),糖基转移酶基因(o
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