【摘 要】
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目的 通过生物信息学方法分析与子宫内膜癌(EC)发病及预后相关的基因.方法 下载基因表达综合数据库(GEO)中相关样本的基因芯片数据,筛选出EC与正常子宫内膜组织细胞中的差异表达基因(DEGs).运用STRING在线数据库及DAVID在线数据库对DEGs进行蛋白-蛋白互作网络(PPI)分析、基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析,并利用Cytoscape软件筛选出关键基因.通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的子宫内膜癌的生存资料对关键基因进行生存分析.结果 本研究共筛选出
【机 构】
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郑州大学第一附属医院妇产科,河南郑州 450000
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目的 通过生物信息学方法分析与子宫内膜癌(EC)发病及预后相关的基因.方法 下载基因表达综合数据库(GEO)中相关样本的基因芯片数据,筛选出EC与正常子宫内膜组织细胞中的差异表达基因(DEGs).运用STRING在线数据库及DAVID在线数据库对DEGs进行蛋白-蛋白互作网络(PPI)分析、基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析,并利用Cytoscape软件筛选出关键基因.通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的子宫内膜癌的生存资料对关键基因进行生存分析.结果 本研究共筛选出EC相关108个DEGs,其中10个关键基因为JUN、UBE2I、WT1、GATA2、WNT2、CXCL12、ZEB1、TCF4、FOXL2、PRKCA,均在 EC 中相对高表达.WNT2、TCF4和 FOXL2关键基因对患者的生存率差异有统计学意义(P＜0.05).Wnt信号通路可能对EC的发病有重要作用.结论WNT2、TCF4和FOXL2与EC的发病及预后有着密切关系,为EC新的诊断标志物和治疗靶点筛选提供新思路.
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