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目的 通过分析2012-2013年北京市流感流行季(2012年9月-2013年4月)流感样病例监测与流感病原学监测结果的相关性,评价北京市一级以上医疗机构和二级以上医疗机构流感样病例监测工作的适用性和有效性.方法 分析北京市421家一级以上医疗机构和144家二级以上医疗机构的流感样病例监测数据,按周次分别与北京市14家医疗机构开展的流感病原学监测数据进行相关性分析和回归检验.结果 一级以上和二级以上医疗机构门急诊流感样病例百分比(ILI%)与流感病毒病原学监测中病毒分离阳性率成正相关(一级医院r =0.794,P<0.001;二级医院r=0.787,P<0.001).一级以上和二级以上医疗机构ILI%与流感病毒分离阳性率的回归确定系数r2分别为0.630(P <0.001)和0.620(P <0.001).结论 一级以上和二级以上医疗机构流感样病例中归因为流感病毒感染的比例基本一致,从成本效益分析角度考虑,北京市利用144家二级以上医疗机构开展流感样病例监测已经可以满足对疾病监测的需要,比扩展到421家一级以上医疗机构具有更好的成本效益比。