【摘 要】
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目的 分析孕中期羊水游离RNA(AfcfRNA)转录组,筛选神经发育共表达关键基因.方法 利用基因共表达网络分析,建立AfcfRNA转录组的基因共表达网络模块.筛选各共表达模块中的神经特异性基因,建立神经系统特异性共表达模块.利用基因间相互作用筛选神经组织特异性共表达模块中的关键基因.结果 通过加权基因共表达网络分析共建立27个以颜色命名的共表达模块,在Human Protein Atlas数据库中筛选到832个神经组织特异性基因.在蓝色、棕色、蓝绿色以及黄色模块中富集到前脑发育、神经突触组装和功能、神经
【机 构】
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首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院,北京 100026
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目的 分析孕中期羊水游离RNA(AfcfRNA)转录组,筛选神经发育共表达关键基因.方法 利用基因共表达网络分析,建立AfcfRNA转录组的基因共表达网络模块.筛选各共表达模块中的神经特异性基因,建立神经系统特异性共表达模块.利用基因间相互作用筛选神经组织特异性共表达模块中的关键基因.结果 通过加权基因共表达网络分析共建立27个以颜色命名的共表达模块,在Human Protein Atlas数据库中筛选到832个神经组织特异性基因.在蓝色、棕色、蓝绿色以及黄色模块中富集到前脑发育、神经突触组装和功能、神经递质释放过程、轴突发生以及学习和记忆过程相关的GO术语.通过基因间相互作用以及基因在孕中期的平均表达量分析,共发现蓝色模块(SLC18A3、TACR3、SYT2)、棕色模块(SSTR5、STX1A、SNAP25、GHSR、SSTR4、GABBR2)、蓝绿色模块(DRD2、SLC32A1、GNG3、OPN4、PENK)以及黄色模块(RAB3A、HCRT、GRM5)中的17个关键基因.结论 该研究获得了神经系统发育密切相关的并且具有共表达关系的关键基因,可作为潜在的产前诊断中监测神经系统发育的标志物.
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