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蓝藻中的微囊藻在生长环境不利时会在底泥表面积累，形成休眠体，等到环境条件适宜时，休眠体开始生长，迁移到水中，这便是所谓的“复苏”现象。这种生长策略可以使微囊藻渡过生长环境恶劣的时期从而为种群再生长提供了必需的“种源”。这是一个逐步积累的量变到质变的缓慢过程，整个过程受到环境因素特别是物理因子的影响较大。孔繁翔等提出假设，将蓝藻水华的形成分为相互区别而又连续的四个过程：下沉和越冬（休眠）、复苏、生物量增加、上浮聚集并形成水华，并认为影响每个阶段的主导因子不同。