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新疆维吾尔自治区中医医院成立于1959年7月1日。该医院同时也是新疆医科大学附属中医医院、新疆医科大学第四临床医学院、新疆维吾尔自治区中医药研究院。经50多年的积淀，医院建成新疆中医名医名方研究开发中心、国家中医临床研究基地、国家中医药管理局中西医结合急诊基地、国家中医药管理局第一批中医药标准研究推广基地（试点）建设单位、国家中医药国际合作基地、国家药物临床试验机构、卫生部关节镜诊疗技术培训基地，并设有国家级博士后科研工作站。尤其是近10年来的快速发展，使新疆维吾尔自治区中医医院成为全国规模较大、中西医人才汇聚、学科设置齐全、技术力量雄厚、中医特色突出、设备配套先进，集医疗、教学、科研、预防保健和康复于一体的大型现代化三级甲等中医医院。