为分析新疆乌鲁木齐市活禽市场外环境中禽流感病毒（avian influenza virus, AIV）的遗传特征,于乌鲁木齐市某活禽市场采集环境样品,经接种鸡胚、血凝试验和RT-PCR等方法分离鉴定AIV,病毒全基因组扩增、测序后进行系统进化和分子特征分析。结果显示,从2016年外环境样品分离到2株H5N8 AIVs,其各基因的一致性为85.9%～100.0%,除NA和NS之外的6个基因均聚在不同分支,2株病毒存在差异。同时,2株病毒也存在明显共性,除1株病毒的PB2与山东野鸭中分离的H5N1 AIVs一致性最高并与华东地区家鸭中分离的H5N8 AIVs聚在同一分支之外,其余基因均与2016年底至2017年初自西藏、内蒙古和江苏等地外环境中分离的H5N8 AIVs的相应基因遗传距离最近,并有多个基因与2010-2012年华东地区家鸭中分离的H5N8 AIVs的遗传距离较近。2株分离病毒的HA裂解位点均含5个连续的碱性氨基酸,为高致病性,病毒基因发生的多个突变可增强病毒的毒力和致病力。结果表明,分离的2株高致病性H5N8 AIVs与2016-2017年国内多地外环境以及2010-2012年华东家鸭中分离的H5N8 AIVs的遗传关系较近。