构建6-基因直肠癌新辅助放化疗后区域淋巴结完全退缩的人工神经网络预测模型

来源 :中华消化外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zz1976aa
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

筛选直肠癌新辅助放化疗(CRT)后区域淋巴结完全退缩(ypN-)的分子标志物,构建基于人工神经网络(ANN)的CRT后ypN-的预测模型。

方法

从公共基因芯片数据库下载一组直肠癌新辅助放化疗患者的芯片数据(GSE46862),包括69例直肠癌样本,共64例样本纳入研究。21例直肠癌CRT后ypN-设为ypN-组,43例直肠癌CRT后区域淋巴结阳性残留(ypN+)设为ypN+组。通过GCBI在线平台分析数据。比较直肠癌CRT后ypN-组与ypN+组的基因表达谱,寻找差异表达基因以筛选分子标志物。通过绘制受试者工作特征(ROC)曲线筛选排名前6名的差异表达基因进行模型构建。ANN预测模型构建采用SPSS Modeler完成。按照7∶3将总样本随机裂解成训练样本和测试样本。运用训练样本进行ANN预测模型构建,用测试样本进行独立回代验证。观察指标:(1)差异表达基因筛选结果。(2)ANN预测模型分析结果。绘制ROC,计算曲线下面积(AUC)评估各分子标志物和ANN预测模型的预测能力。

结果

(1)差异表达基因筛选结果:共筛选出50个差异表达基因。前6名的基因分别为IL6、AKR1B1、AREG、SELE、ROBO1、CD274。(2)ANN预测模型分析结果:选择上述6个基因,构建ANN预测模型。该ANN为3层7-5-2结构。对ANN贡献最大的是IL6,之后分别为ROBO1、AKR1B1、AREG、CD274、SELE。该模型的AUC为0.929。其灵敏度为96.7%,特异度为85.7%,预测训练样本的准确率为93.2%。当进行独立回代时,其预测灵敏度为92.3%,特异度为85.7%,预测独立测试样本的准确率为90.0%。

结论

基于多分子标志物(IL6、ROBO1、AKR1B1、AREG、CD274、SELE)成功构建了CRT后ypN-的精准预测模型,稳定性好,可为直肠癌CRT后保直肠手术的临床决策提供参考。

其他文献
目的探讨肠外瘘患者确定性手术前非甲状腺疾病综合征(NTIS)对术后手术部位感染(SSI)的预测价值。方法采用回顾性病例对照研究方法。收集2014年4月至2016年11月解放军南京总医院收治的264例行确定性手术治疗的肠外瘘患者(181例甲状腺功能正常和83例NTIS患者)的临床资料,行确定性手术治疗后86例患者发生SSI设为SSI组,178例患者未发生SSI设为无SSI组。观察指标:(1)术后发生
目的分析影响克罗恩病肠切除术后切口感染的危险因素。方法采用回顾性病例对照研究方法。收集2007年1月至2016年12月中山大学附属第六医院收治的239例克罗恩病行肠切除术患者的临床病理资料。患者均行肠切除术。观察指标:(1)手术情况。(2)随访情况。(3)影响术后切口感染的危险因素分析。(4)影响患者术前贫血的临床因素。采用门诊或病房接诊方式进行随访,随访内容为术后30 d内切口感染情况。随访时间
腹茧症是一种罕见的、自身免疫系统紊乱的腹膜疾病,是由一层增厚的腹膜包裹或部分包裹小肠引起的急、慢性肠梗阻疾病。其发病原因及机制尚未完全清楚,需要进一步研究结果证实。腹茧症的临床特征缺乏特异性,容易造成误诊、漏诊,治疗上尚未形成完善的诊断与治疗规范。随着CT检查、腹腔镜等技术的推广和普及,腹茧症的诊断与治疗水平有所提高。虽然保守治疗可以延缓腹膜硬化进程,但不能从根本上解决问题。手术治疗仍为腹茧症患者
目的比较达芬奇机器人手术系统辅助与腹腔镜辅助胃肠间质瘤手术的近期临床疗效。方法采用回顾性队列研究方法。收集2016年6月至2018年5月中国人民解放军兰州军区兰州总医院收治的98例胃肠间质瘤患者的临床资料。98例患者中,45例行达芬奇机器人手术系统辅助胃肠间质瘤手术,设为机器人组;53例行腹腔镜辅助胃肠间质瘤手术,设为腹腔镜组。手术由副主任医师以上级别医师施行。肿瘤直径<5 cm的胃间质瘤行楔形切
目的比较3D和2D腹腔镜胃十二指肠穿孔修补术的临床疗效。方法采用回顾性队列研究方法。收集2014年7月至2017年12月赣州市人民医院收治的92例行腹腔镜胃十二指肠穿孔修补术患者的临床病理资料。44例患者行3D腹腔镜胃十二指肠穿孔修补术,设为3D腹腔镜组;48例患者行2D腹腔镜胃十二指肠穿孔修补术,设为2D腹腔镜组。观察指标:(1)术中及术后恢复情况比较。(2)术后药物敏感试验及病理学检查情况。(
目的比较腹腔镜与开腹全结直肠切除回肠储袋肛管吻合术治疗溃疡性结肠炎的临床疗效。方法采用回顾性队列研究方法。收集2003年1月至2016年12月上海交通大学医学院附属仁济医院收治的150例行全结直肠切除回肠储袋肛管吻合术治疗溃疡性结肠炎患者的临床资料。150例患者中,87例行腹腔镜全结直肠切除回肠储袋肛管吻合术,设为腹腔镜组;63例行开腹全结直肠切除回肠储袋肛管吻合术,设为开腹组。观察指标:(1)术
目的探讨肠系膜上静脉血栓远期并发缺血性肠病的诊断与治疗要点。方法采用回顾性横断面研究方法。收集2009年1月至2017年6月解放军南京总医院收治的36例肠系膜上静脉血栓远期并发缺血性肠病患者的临床资料。诊断方法:询问病史,体格检查,实验室检查,影像学检查。治疗方法:根据患者营养状态行肠外营养支持治疗,择期行一期肠切除联合肠吻合术或行一期肠切除造口术;二期行确定性手术恢复消化道连续性。术后予抗凝治疗
目的总结会阴部残留窦道(PPS)的MRI检查影像学特征。方法采用回顾性描述性研究方法。收集2010年7月至2017年1月南京中医药大学附属医院收治的7例PPS患者的临床资料。患者均为直肠癌经腹会阴联合切除术后。患者行MRI检查横轴位、矢状位和冠状位扫描,由两名副主任医师以上级别医师共同阅片,若诊断意见不统一,则协商后统一结果。观察指标:(1)MRI检查影像学特征。(2)治疗和随访情况。患者完成MR
肠黏膜机械屏障是维持机体内环境稳态重要的结构之一。炎症性肠病、坏死性小肠结肠炎及梗阻性黄疸患者不良的预后结局与肠黏膜机械屏障功能的破坏关系密切。长期高脂饮食、梗阻性黄疸导致胆汁酸代谢异常,而这些病理状况常伴随肠黏膜屏障功能的破坏。因此,胆汁异常代谢与肠黏膜机械屏障功能的相互关系引起了研究者的兴趣。他们发现:胆汁中的重要成分胆汁酸与肠道屏障功能关系密切。笔者回顾近年的相关文献,从胆汁酸不足、胆汁酸过