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同工酶可作为遗传图谱构建和无性系鉴别的重要遗传标记，以９２个日本落叶松无性系种子为实验材料，采用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳法，取其胚乳进行了同工酶分析，结果表明：１１种酶系统至少由２４个基因座所控制，多数座位存在２个或２个以上的等位基因；多数座位等位基因的基因频率差异很大；各无性系之间至少在一个以上的基因座上存在差异。并确定了９２个无性系的同工酶基因型。