生物信息学研究新基因LRP15

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为了利用生物信息学探索网上克隆基因与预测基因功能的新方法,首先用一段1 8kb DNA片段在人类EST数据库中进行电子杂交并对相互重叠的EST片段组装,通过引物设计进行cDNA末端快速扩增.以高通量基因组序列(HTGS)数据库及SAGE文库为基础,进行染色体定位及组织表达分析.通过DAS及RPS-BLAST程序预测其蛋白质结构及功能.结果显示,LRP15 cDNA全长1 718 bp,含一个780 bp的开放读码框架,编码259个氨基酸.该基因定位于染色体3p24,在多种组织中表达.其编码蛋白含有N端富含亮氨酸重复序列及潜在的穿膜序列.研究表明,生物信息学是克隆与预测基因功能的有效方法;LRP15基因可能是一个参与细胞发育调控的新基因.
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