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目的：分析自发性高血压大鼠（SHR）肠道菌群结构特征，初步探讨中药黄连解毒汤（HLJDD）干预作用影响。 方法：12周龄雄性SHR随机分模型组（M组）、HLJDD组（H组），同周龄雄性Wistar大鼠为正常对照组（W组），每组各4只。空白对照组及模型组常规饲养，HLJDD组按0.027 g/kg/d灌胃给药，每天给药1次，连续给药6 W。干预结束后，取出盲肠内容物（新鲜粪便），采用16S rDNA高通量测序并进行生物信息学分析。结果：3组大鼠肠道微生物测序覆盖度在0.997以上，从属水平分析3组大鼠物种丰度聚类分布于4个优势的细菌门：27个属于厚壁菌门类（Firmicutes）、4个属于拟杆菌门类（Bacteroidetes）、3个属于变形菌门类（Proteobacteria）和1个属于疣微菌门类（Verrucomicrobia）门类细菌；Simpson指数表明，模型组大鼠肠道菌群多样性降低，HLJDD组大鼠肠道菌群多样性高于模型组；3组大鼠肠道菌群微生物群落结构在门水平上主要由厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroidetes）和变形菌门（Proteobacteria）组成，其中模型组厚壁菌门（Firmicutes）相对丰度增加，HLJDD组大鼠肠道菌群厚壁菌门（Firmicutes）的相对丰度低于模型组；3组大鼠肠道菌群微生物群落结构在属水平上主要由乳酸杆菌属（Lactobacillus）、肠球菌属（Enterococcus）、大肠志贺氏杆菌属（Escherichia Shigella）组成，其中益生菌乳酸杆菌属（Lactobacillus）相对丰度在模型组明显降低，HLJDD组大鼠肠道菌群乳酸杆菌属相对丰度高于模型组。结论：SHR肠道菌群结构失于平衡状态，菌群多样性有一定程度下降，HLJDD可能通过增加SHR菌群多样性、降低SHR致病菌厚壁菌门（Firmicutes）的相对丰度、升高SHR益生菌乳酸杆菌属相对丰度达到对抗高血压的作用，尚需扩大样本量进一步进行验证。