人TERT基因启动子区生物信息学分析

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目的:探讨人端粒酶逆转录酶基因启动子区的序列特征、转录因子及其结合位点.方法:从NCBI数据库中获取人TERT基因组序列及其启动子序列:利用EMBOSS 6.6.0、CpG finder 1.0和MethPrimer 1.0软件预测启动子区CpG岛的位置;利用Patch 1.0和PROMO 3.0.2软件预测可与TERT基因结合的潜在转录因子及结合位点.结果:TERT基因定位于5p15.33,基因序列全长共41881 bp,其启动子位于TERT基因5′端上游2500 bp处,全长2043 bp.TERT基因启动子区可能存在2个CpG岛和118个转录因子.结论:通过生物信息学软件对hTERT基因启动子进行预测分析,可提高对hTERT基因启动子的研究效率,以便更加深入了解hTERT基因的调控机制及其生物学功能.
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