【摘 要】
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利用寡核苷酸芯片检测方法分析CYP1A1单核苷酸多态性(SNP)和GSTM1缺失与否,实验结果证明了寡核苷酸芯片技术可并行、准确、高效地检测基因的单核苷酸多态性和其他类型的基因
【机 构】
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上海博星基因芯片有限责任公司,复旦大学生命科学学院遗传学研究所遗传工程国家重点实验室,联合基因科技集团有限公司
【基金项目】
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国家高技术研究发展计划(863计划);
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利用寡核苷酸芯片检测方法分析CYP1A1单核苷酸多态性(SNP)和GSTM1缺失与否,实验结果证明了寡核苷酸芯片技术可并行、准确、高效地检测基因的单核苷酸多态性和其他类型的基因多态型,可为疾病遗传易感性及单体型的研究提供强有力的研究工具.采用该寡核苷酸芯片,检测了84份正常人的血液DNA样本,其中GSTM1基因缺失率达到47.6%,接近报道数值.统计分析发现,CYP1A1 m1-m2的3种基因型组合TT-AG、TT-GG和TC-GG的发生频率都为0,而根据实验得到的m1和m2各自基因型数据计算,它们的发生频率应是11.4%、2.6%和3.1%,所以推测在所检测的样本中没有T(m1位点)和G(m2位点)的连锁组合,即m1和m2位点的组合只有3种单体型:T-A、C-A和C-G,其发生频率分别是69.6%、7.7%和22.6%.
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