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单克隆菌落挑选仪是集光学成像、图像识别和自动控制等技术于一身,应用于生物工程领域的一种高端仪器。对12×8阵列挑选针和无序排列的菌落目标,只有对挑选路径和顺序进行优化,才能有效提高挑选通量。针对这一需求,利用蚁群算法的基本原理,对单克隆菌落挑选仪挑选路径进行了优化。仿真实验结果表明,该算法可以有效提高挑选效率。