各基因亚型乳腺癌间基因组拷贝数变异的比较

来源 :肿瘤防治研究 | 被引量 : 0次 | 上传用户：laiyongxuan

【摘要】

：

目的比较各基因亚型乳腺癌间全基因组拷贝数变异(CNV)差异,分析各亚型中特异的基因CNV。方法在肿瘤基因组图谱(TCGA)的乳腺癌数据库中,利用AIMS软件进行基因分型(BasL型、Her

【作者】

：

王智辉钟媚共陈秋旋孟子杰伍婉婷郑焱张鑫

【机构】

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江门市中心医院肿瘤科,江门市妇幼保健院药学部,江门市中心医院中心实验室,广东省人乳头状瘤病毒（HPV）相关疾病分子诊断工程技术研究开发中心

【出处】

：

肿瘤防治研究

【发表日期】

：

2021年4期

【关键词】

：

乳腺癌基因分型拷贝数变异 Breast cancer Gene subtypes Copy number variations

【基金项目】

：

国家自然科学基金(81802918),中国博士后科学基金(2019M660206),广东省自然科学基金(2019A1515011565,2018A030310007),广东省医学科研基金(B2020104),江门市基础与应用基础研究重点项目(2019030102430012905,2020030103140008978)

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目的比较各基因亚型乳腺癌间全基因组拷贝数变异(CNV)差异,分析各亚型中特异的基因CNV。方法在肿瘤基因组图谱(TCGA)的乳腺癌数据库中,利用AIMS软件进行基因分型(BasL型、Her2型、LumA型和LumB型),GISTIC2.0软件分析肿瘤组织中全基因组拷贝数变异情况。收集整理江门市中心医院(JMCH)324例浸润性乳腺癌患者信息与样品,利用荧光定量PCR检测肿瘤组织中ERBB2、TFDP1、MIR148B、CCND1、MDM2和MIR139基因拷贝数变异,对TCGA分析进行验证。结果BasL型

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