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基于DNA水平的生物遗传多态性分析大大丰富了生物多样性的发现和分析。近年来，对于基因多态性的研究及基因标记技术迅速发展。目前用于多态性分析的方法主要有限制性片段长度多态性（RFLP）、随机引物PCR（RAPD）、脉冲场凝胶电泳（PFGE）、细菌的核糖体基因分型（Ribotyping）、多位点序列分析（MIST）以及扩增片段长度多态性（AFLP）等。这些方法所得到的多态性，都是运用染色体DNA通过限制性内切酶消化或，和PCR扩增的方法，根据带型中一些特征条带的存在或缺失来比较。带型的差异是实验菌株之间遗传距