甲型流感病毒PB1-PA蛋白作用位点的发现与分析

来源 :中山大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：guanxinpp

【摘要】

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基于共进化理论,探究了甲型流感病毒PB1蛋白与PA蛋白上具有共同进化可能性的保守九聚片段（C9MP）。结构信息显示PB1蛋白的第1-15位氨基酸与PA蛋白的第239-716位氨基酸具有相互作

【作者】

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何淼林强乾赵艳超张淑波陈维田

【机构】

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中山大学生命科学学院,香港理工大学屋宇设备工程系

【出处】

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中山大学学报(自然科学版)

【发表日期】

：

2011年2期

【关键词】

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共进化理论甲型流感病毒 PB1蛋白 PA蛋白相互作用位点 co-evolution theory influenza A virus PB1 PA

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基于共进化理论,探究了甲型流感病毒PB1蛋白与PA蛋白上具有共同进化可能性的保守九聚片段（C9MP）。结构信息显示PB1蛋白的第1-15位氨基酸与PA蛋白的第239-716位氨基酸具有相互作用域;对该区域变异分布的分析发现,PA蛋白第670位氨基酸Q所在的C9MP与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V和第13位氨基酸P所在的C9MP在PB1MP1相互作用面上具有最低的共进化值。结合DSSP程序的分析表明,由PA蛋白第670位氨基酸Q与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V与第13位氨基酸P构

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