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醌蛋白又称醌酶，是一类以吡咯喹啉醌（PQQ）或其结构类似物（TTQ、TPQ或LTQ）为辅助因子的氧化还原酶。以PQQ为辅酶的醌蛋白是其中最重要的一类醌蛋白。按其在氧化还原反应过程中包含辅酶的种类和数量可以分为Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型等3种型别。Ⅰ型醌蛋白是一类简单的醌蛋白，只含有1分子的PQQ作为辅酶；而Ⅱ型和Ⅲ型醌蛋白含有PQQ和血红素c作为辅酶。Ⅱ型醌蛋白包含1分子PQQ和1分子血红素c，广泛存在于假单胞菌属、丛毛单胞菌属细菌的胞外周质中，参与催化反应过程。Ⅲ型醌蛋白仅存在于醋酸菌属细菌的细胞膜上，由3个亚基