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本文从地球生命是物质、能量、信息三大要素综合集成的角度，阐述作为生命科学与信息科学相结合的生物信息学，在２１世纪的科学研究中的重要作用和地位。同时从决定论和非决定论、可逆性和不可逆性、物理退化（熵增加）与生物进化（熵减少）、个体描述与群体描述等等科学方法论的角度，论述系统科学对创建生物信息学的指导意义和途径。最后以开发新世纪计算机为例说明研究生物信息学的应用潜力和价值。