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省域次级中心城市选择问题，是区域平衡发展、协调发展的关键，目前选择区域次级中心城市的方法多为定性探讨，存在科学性和满意性较差等缺陷。从系统角度出发辅助决策，基于径向基神经网络构建能够综合考虑多种指标因素的选择模型，并以云南省为例进行实证论证，最后围绕发展次级中心区域经济、协同重构区域功能布局、加强区域问人才、技术联系等提出了发展建议。