【摘 要】
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为获得化州柚和柚的转录组数据及黄酮类成分生物合成相关的差异表达基因,采集化州柚和柚的嫩叶样本作为受试材料,采用高通量二代测序技术进行转录组测序,并运用Nr、Swiss-Pro
【机 构】
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广东食品药品职业学院,广州中医药大学
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(81803693),广东省教育厅科研平台特色创新项目(2018GKTSCX040),广东省中医药局科研项目(20191235)
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为获得化州柚和柚的转录组数据及黄酮类成分生物合成相关的差异表达基因,采集化州柚和柚的嫩叶样本作为受试材料,采用高通量二代测序技术进行转录组测序,并运用Nr、Swiss-Prot、KOG、KEGG等网络数据库进行转录组中表达基因功能的生物信息学分析,共组装得到116202个单基因(Unigene),注释了68923个单基因(59.31%),柚转录组中表达基因有94798个,化州柚中表达基因107196个,化州柚与柚的转录组差异表达基因共6419个.结果表明:化州柚相对于柚上调基因有3799个,占差异表达基因
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