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制约畜牧业发展的关键在于畜禽良种的生产水平。目前，牡丹江市已建成全省重点种猪场12个，市级二元母猪场17个，父母代肉种鸡场和蛋种鸡场7个。同时还建成了全省规模最大，质量最好的绵肉羊胚胎移植基地和奶牛胚胎移植基地。上述良繁体系不但为省内外提供了大量的种猪、种鸡、种牛、种羊，还为省内外提供了优质高产奶牛胚胎和绵肉羊胚胎。