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以苦瓜自交系29和惠州大顶为亲本构建6个世代(P1、P2、F1、B1、B2、F2)群体,分别对苦瓜单瓜种子数和苦瓜种皮颜色进行遗传分析。结果表明,苦瓜单瓜种子数的遗传符合2对等显性主基因+加性-显性多基因混合遗传模型(E-6模型),由主基因和多基因共同控制,多基因显性效应较大,F1表现出超亲优势。苦瓜种皮颜色的黑色对棕黄色表现为1对基因控制的显性遗传。