目的:以法尼基转移酶(farnesyltransferase,FTase)为载体,阐释何首乌蒽醌类化合物抗肿瘤作用的分子机制并筛选其中具有抑制FTase活性的化合物。方法:利用Common Feature Pharmacophore Generation(Hiphop)模块构建定性药效团,并根据评价参数获得最优药效团,利用最优药效团虚拟筛选何首乌蒽醌类化合物;利用分子对接技术精制筛选结果获得活性化合物并对活性化合物进行分析,以阐释何首乌蒽醌类化合物抗肿瘤作用的分子机制。结果:最优药效团模型包含3个疏水基团、2个氢键受体以及5个排除体积,其有效命中率(HRA)为92.47%、辨识有效性指数(IEI)为2.250、综合评价指数(CAI)为2.080。利用最优药效团筛选何首乌蒽醌类成分,初步获得3个潜在的蒽醌类活性成分;利用分子对接技术进一步筛选,得到大黄素-8-O-β-D-吡喃葡萄糖苷、大黄酚-8-O-β-D-吡喃葡萄糖苷、大黄素-8-O-(6’-O-乙酰基)-β-D-吡喃葡萄糖苷等3个化合物。结论:大黄素-8-O-β-D-吡喃葡萄糖苷、大黄酚-8-O-β-D-吡喃葡萄糖苷、大黄素-8-O-(6’-O-乙酰基)-β-D-吡喃葡萄糖苷能够抑制FTase的活性,是何首乌中蒽醌类化合物抗肿瘤的重要组分。