【摘 要】
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为了对1株番鸭细小病毒(MDPV)分离株NY18株的分子特征予以准确揭示,通过设计重叠PCR 引物,扩增NY18株的完整基因组并进行了测序.结果显示,NY18株基因组由5 071个碱基组成,5'
【机 构】
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扬州大学兽医学院江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心,江苏扬州225009
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为了对1株番鸭细小病毒(MDPV)分离株NY18株的分子特征予以准确揭示,通过设计重叠PCR 引物,扩增NY18株的完整基因组并进行了测序.结果显示,NY18株基因组由5 071个碱基组成,5'和3'端末端倒置重复序列(inverted terminal repeats,ITR)均由424个碱基组成,其外侧385个碱基形成回文发夹结构.Simplot 3.5.1和RDP4软件分析表明,NY18株经历了2次重组事件,第1次重组产生在VP3基因的1.1 kb区域,第2次重组事件产生在P9启动子至Rep基因上游约100 bp区域内.2次重组均以经典型MDPV YY株作为主要亲本,而经典型鹅细小病毒(GPV)强毒株DY16和鹅胚化的弱毒疫苗株SYG61v作为次要亲本参与了重组.NY18株的ITR与经典型MD-PV FM和YY株的同源性为97.9％和99.1％,而与GPV强毒株YZ99-6的同源性仅有86.0％,表明NY18株ITR仍来自于经典型MDPV.以VP1基因1.1 kb重组区片段构建遗传进化树,NY18株与经典型GPV处于同一分支,而以非重组区的Repl基因1 774 bp和VP1基因氨基端694 bp、羧基端405 bp片段分别构建遗传进化树,NY18株则与经典型MDPV处于同一分支.结果表明,NY18株既不同于经典型MDPV也不同于GPV,其本质是1株重组型的MDPV.
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