【摘 要】
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[目的]获得玉米的PEPC基因,并对其生物信息学进行分析。[方法]使用RT-PCR方法由玉米中获得PEPC全长c DNA,构建克隆载体后进行测序,并对其序列进行生物信息学分析。[结果]获得
【机 构】
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新疆农业科学院核技术生物技术研究所,农业部荒漠绿洲作物生理生态与耕作重点实验室
【基金项目】
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新疆农业科学院青年基金项目(xjnkq-2013025)
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[目的]获得玉米的PEPC基因,并对其生物信息学进行分析。[方法]使用RT-PCR方法由玉米中获得PEPC全长c DNA,构建克隆载体后进行测序,并对其序列进行生物信息学分析。[结果]获得的玉米PEPC基因CDS全长2 913 bp,编码的多肽链包含970个氨基酸,为疏水性氨基酸,由α-螺旋（61.44%）、无规则卷曲（34.43%）和延伸链（4.12%）组成,定位于细胞质,不存在跨膜结构域,其175970位氨基酸组成了磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的功能结构域,在173184、597609位具有2个磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶活性位点。[结论]该研究克隆了玉米C4型丙酮酸磷酸双激酶（PPDK）基因,它所编码的氨基酸序列具备PPDK蛋白的保守序列和催化活性中心区域。
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