hIL-6·hIL-6Rα·gp130三元复合物的结构预测

来源 :生物化学与生物物理进展 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ghchao0605
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通过Delphi方法分析人白介素 6 (humaninterleukin 6 ,hIL 6 ) /人白介素 6受体α亚基 (humaninterleukin 6receptorαsubunit,hIL 6Rα)复合物、gp130 (βsubunit)的空间构象的表观静电分布 ,利用分子对接方法研究 gp130与hIL 6 /hIL 6Rα复合物作用形成三元复合物的空间构象 ,经过分子力学优化、分子动力学常温动态模拟借助分子间相互作用 (范德华力、氢键、盐键等 )、反应自由能理论探讨hIL 6·hIL 6Rα·gp130复合物稳定构象结合部位的结构域 .分析结果表明 ,gp130蛋白表面富集较强的负电势 ,复合物hIL 6 /hIL 6R一侧表面富集较强的正电势 ,gp130借助蛋白表面的静电作用结合hIL 6 /hIL 6R复合物 ,介导hIL 6信号 ;hIL 6中的helix C、loop BC、loop CD参与同 gp130中的loopEF、linker、loopA′B′、loopB′C′、loopD′E′作用 ,hIL 6R中的loopA′B′、β strandE′参与同gp130中的loopA′B′、β strandE′作用 .
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