目的:研究北京市2017年医药分开综合改革对医疗费用及其结构的影响.方法:从全军合理用药监测网数据库中提取位于北京市的军队三级甲等医疗机构门诊和住院医疗中产生的全部就诊和费用数据,计算就诊人次和费用并将费用划分为药品、诊疗、材料和其他等四类,采用成分数据分析方法结合分段线性回归模型对2017年北京市医药分开综合改革实施前后医疗费用及其结构的变化进行分析.结果:医药分开改革使样本医院门诊和住院次均费用分别降低了44.7和414.9元,但对次均医疗费用的变化趋势没有显著影响.医疗总费用中药占比下降了5.8％,相应的诊疗收入占比上升了6.1％.门诊和住院医疗费用中药占比分别下降4.8％和5.8％,诊疗费用占比则分别上升了3.9％和6.4％.医院药品收入损失主要由诊疗收入补偿.医药分开改革对医疗费用结构的变化趋势影响不显著,材料和其他费用的占比在改革实施后均没有显著的变化趋势.结论:北京市医药分开综合改革有效控制了医疗费用的过快增长,基本实现了以医事服务费补充药品收入损失的目标,但医疗收入中药占比仍然很高,需要继续深化改革,进一步降低药品费用占比.