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产地检疫后动物检疫员对动物、动物产品做出合格与不合格处理，合格后的要进入流通领域，不合格的要做无害化处理，这时就需要与产地检疫相配套的检疫消毒来与之呼应，在流通前、后、中切断易感途径，以达到切断或消除动物病源传播的目的，现在的检疫消毒主要包括装前消毒、卸后消毒、外包装消毒、畜禽产品消毒和无害化处理消毒。