【摘 要】
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目的筛选能高效特异结合Akkermansia muciniphlia(A.muciniphlia)的核酸适配体,为后续利用适配子进行A.muciniphlia的检测和鉴定奠定基础。方法合成83bp随机ssDNA文库,运用指
【机 构】
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四川大学华西公共卫生学院(华西第四医院),
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目的筛选能高效特异结合Akkermansia muciniphlia(A.muciniphlia)的核酸适配体,为后续利用适配子进行A.muciniphlia的检测和鉴定奠定基础。方法合成83bp随机ssDNA文库,运用指数富集配体系统进化技术,筛选A.muciniphlia的核酸适配体,并对其进行序列测定、结构分析、解离常数(KD值)测定及特异性验证。结果经8轮筛选后,随机ssDNA文库的亲和力从5.23上升56.99,筛选出的适配体富集库经克隆、测序后得到16条不同的核酸序列,根据同源性分成3个家族,最终筛选到2条对A.muciniphlia有较高亲和力的高频适配体,相应的KD值分别为34.8nmol/L和12.8nmol/L(P<0.05)。结论本文首次筛选出了对A.muciniphlia具有较高亲和力和特异性的适配体,有望用于A.muciniphila的鉴定和检测。
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