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针对高速实时处理的要求，提出了4096点快速傅立叶变换（FFT）模块在现场可编程门阵列（FPGA）中的设计和实现。在运算模块中，基于按频率抽取基-4算法提出了一种新型的基-16蝶型算法，并采用八级流水结构和四路转换器来实现。本文采用块浮点和循环存储结构，避免了溢出和节省了大量的硬件资源。实验结果表明，该方法在保证了运算精度和实现复杂度的同时，使运算速度相对于基-4算法提高了1倍。