【摘 要】
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采用PCR-SSCP、克隆测序和生物信息学等方法对烟台黑猪SLA-DQA基因多态性进行研究,预测其蛋白质结构并分析其功能特征。结果显示：SLA-DQA基因exon 2、exon 3、exon 4分别检测
【机 构】
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甘肃农业大学动物科学技术学院,河南省漯河市畜牧局,甘肃省现代养猪工程技术研究中心
【基金项目】
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DQA和DRA基因与仔猪腹泻死亡的分子标记技术项目（GNSW-2008-04）, 高繁殖力猪新品系选育研究项目（092NKDA036）, 甘肃省优质猪肉生产配套技术研究与示范项目（0804NKCA065）
论文部分内容阅读
采用PCR-SSCP、克隆测序和生物信息学等方法对烟台黑猪SLA-DQA基因多态性进行研究,预测其蛋白质结构并分析其功能特征。结果显示：SLA-DQA基因exon 2、exon 3、exon 4分别检测出4种等位基因,5种基因型、6种等位基因,8种基因型、4种等位基因,7种基因型,包括3种新等位基因。SLA-DQA基因共编码255个氨基酸,编码区共发现32个核苷酸突变和13个氨基酸变异,exon 2多态性最为丰富。蛋白质结构预测结果显示二级结构中无规则卷曲和延伸链比例最高,α螺旋数量多且集中,β折叠最少。
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