【摘 要】
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对458 220条大豆EST序列进行SSR搜索,共检测出EST-SSR序列39 989条, 经拼接得到无冗余EST-SSR序列8 190条,包括357种重复基元.其中二、三核苷酸重复基元类型居多,分别占无冗
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对458 220条大豆EST序列进行SSR搜索,共检测出EST-SSR序列39 989条, 经拼接得到无冗余EST-SSR序列8 190条,包括357种重复基元.其中二、三核苷酸重复基元类型居多,分别占无冗余EST总数的11.13%和16%,统计得到二核苷酸重复类型12种,三核苷酸重复类型60种.以含有简单重复序列的无冗余EST序列设计200对引物,其中148对引物有清晰且单一条带扩增产物,以30份大豆品种资源进行引物筛选,获得多态性引物31对.以21份大豆不同基因型的基因组DNA为模板选取30对显示多态性的大豆EST-SSR引物和30对大豆基因组SSR引物进行扩增,带型统计结果显示:大豆EST-SSR与基因组SSR在供试基因型间多态性指数均值分别为0.55 和0.44,二者揭示的多态性水平差异不大.从而说明利用生物信息学方法基于大豆EST开发SSR标记是切实可行的,大豆EST-SSR可以用于大豆遗传多样性分析,是大豆DNA分子标记体系的一个重要补充.
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