乳腺癌中靶向抑制C8orf33基因表达的miRNA预测和验证的研究

来源 :重庆医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：spyxin

【摘要】

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目的预测并初步验证乳腺癌中靶向抑制8号染色体开放阅读框33(C8orf33)基因表达的微小RNA(miRNA)。方法使用癌症基因组图谱(TCGA)高通量数据进行泛癌症分析,首次发现包括乳腺

【作者】

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庄莹樊伟平赵小芳凌存保杜欣娜

【机构】

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江苏医药职业学院基础医学部

【出处】

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重庆医学

【发表日期】

：

2020年1期

【关键词】

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高通量数据 8号染色体开放阅读框33 微小RNA 乳腺肿瘤 high-throughput datachromosome 8 open reading fram

【基金项目】

：

江苏省卫生和计划生育委员会科研课题(Y2018101),江苏省高等学校自然科学研究面上项目(18KJB310002),江苏省盐城市医学科技发展计划项目(YK2017050),江苏医药职业学院科技创新团队项目(20188104)

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目的预测并初步验证乳腺癌中靶向抑制8号染色体开放阅读框33(C8orf33)基因表达的微小RNA(miRNA)。方法使用癌症基因组图谱(TCGA)高通量数据进行泛癌症分析,首次发现包括乳腺癌在内的多种肿瘤组织中C8orf33基因较正常组织高表达,使用该数据库进一步分析发现C8orf33基因在不同肿瘤组织中表达也有差异性。使用Oncomine对上述结果进行验证,Oncomine分析结果与TCGA高通量数据分析结果相一致。进一步通过starBase V2.0中PITA、clipExpNum和miRmap 3种

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