芝麻全基因组Hsp70基因的鉴定与生物信息学分析

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利用隐马可链夫模型(HMM)对芝麻全基因组Hsp70基因进行了系统分析,共鉴定出21个Hsp70基因,其中17个属于Dnak基因亚家族,4个属于Hsp110/SSE基因亚家族。根据系统进化树分析和亚细胞定位结果,将芝麻21个Hsp70基因分为6个亚组,其中Ⅰ亚组3个,定位于叶绿体;Ⅱ亚组2个,定位于线粒体;Ⅲ亚组5个,定位于内质网;Ⅳ亚组6个,定位于细胞质基质;Ⅴ亚组4个,属于Hsp110/SSE基因家族;Ⅵ亚组1个。芝麻Hsp70基因启动子区域顺式作用元件功能预测结果显示,Hsp70基因参与芝麻的生长发
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