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肿瘤严重危害人类健康，早期诊断、早期治疗可显著降低患者的死亡率，是肿瘤防治研究方向的重点，而深入认识癌症的发病原因和机制则是实现癌症早期诊治的关键。近年来，新兴的蛋白质组学技术可从整体上研究疾病的发生机制，寻找与疾病相关的标志蛋白，为肿瘤研究提供了新思路和新平台。蛋白质组学可以大规模地定量分析细胞内蛋白质的表达水平变化、翻译后修饰变化等，并可深入研究蛋白质间的相互作用，非常有利于发现调控肿瘤进程的关键因子。本文概述了目前蛋白质组学研究中的主要策略和技术，及其在肿瘤标记物筛选和作用机制研究中的应用进展。