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根据生物信息研究工作中对基因数据处理的实际需要,通过对生物大分子序列分析软件需具备的功能进行分析,并按照面向对象的方法,采用BioJava为开发工具,设计和开发了一个适用于生物序列分析的专用软件(SEQAnalysis),该软件具有独特的序列信息量计算及统计功能,并能将序列分布转化为XML格式,实现了生物信息分析的自动化.