基于ITS序列,采用3种构树方法对梅花草属Parnassia L.植物30个种的系统发育进行了研究,分析了梅花草属分类系统的合理性;分析了3对有争议物种的亲缘关系:绿花梅花草P.viridiflora与三脉梅花草P.trinervis、类三脉梅花草P.pusilla与中国梅花草P.chinensis、中国梅花草P.Chinensis与高山梅花草P.cacuminum。结果表明:采用贝叶斯推理构建出的系统发育树在拓扑结构上表现出最高的稳定性;佐证了当前梅花草属植物分类系统的合理性;虽然绿花梅花草和三脉梅花草的ITS序列同源性达99.1%,但在形态学分类尚未作出改变前,仍需要进一步确定两者的亲缘关系;分子分析手段只能推断类三脉梅花草和中国梅花草具有非常相近的亲缘关系,并不能证明为同一物种;推测高山梅花草与中国梅花草二者外观形态可能存在连续性变异,可能为同一物种,需要更多其他分子片段的序列分析进一步证实二者亲缘关系。