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新疆是我国最大的商品棉生产基地。2007年新疆棉花种植面积为178．26万hm^2，占全国的31．9％；皮棉总产量为290万t，占全国的38．2％。20世纪90年代初，中国农业科学院棉花研究所（以下简称“中棉所”）培育的中棉所19进入南疆，开启了中棉所科技力量进入新疆的历史。在随后的几年中，相继引进推广了中棉所35、41、43、49等“中棉”品种，逐步形成了在新疆生产中的优势地位。以优良的品种为先导，中棉所先后在新疆阿克苏、巴州等地（州）成立了五家区域公司，经营自育的“中棉”系列棉花品种，追求产业效益和推