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玉米杂交种丹玉39是当前辽宁玉米生产的主栽品种和区试对照种，为评估其在不同地区的遗传变异度，本试验收集了辽宁主产地丹玉39及其亲本共45份材料，利用SSR标记对其进行检测。结果表明：母本C8605—2遗传一致性较高，而父本丹598和杂交种存在一定程度的变异现象，自然变异、天然异交和人为改良可能是导致丹玉39及其亲本遗传变异的主要原因。