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目的探讨2005年11月1日发生5例不明原因重症肺炎（治愈3例、死亡2例）的发病原因，提出鼠疫自然疫源地调查，确定疫源地的存在。方法采用常规调查方法，通过血清学，鼠疫菌学，基因诊断学等技术进行判定。结果共分离到8株鼠疫杆菌，疫区犬血清阳性率22．99％，猫阳性率21．21％。结论细菌学证实丽江发现鼠疫自然疫源地，并处于流行活跃阶段，发现鼠间有鼠疫的流行。