【摘 要】
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目的 获取高良姜查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)编码基因cDNA序列,明确其序列和功能特征以及在高良姜中的表达模式.方法 在前期高良姜转录组测序数据中挖掘CHS的cDNA全长及其编码区,利用生物信息学方法对该基因蛋白的特征和功能进行分析,运用ClustalX1.83和MEGA4.0软件进行同源性比对和系统进化树构建,采用实时荧光定量PCR(qPCR)分析CHS在高良姜不同组织中的表达差异.结果 高良姜CHS编码区为1173 bp,编码391个氨基酸.其编码蛋白是分子量为94.5
【机 构】
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广东医科大学,广东湛江524023
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目的 获取高良姜查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)编码基因cDNA序列,明确其序列和功能特征以及在高良姜中的表达模式.方法 在前期高良姜转录组测序数据中挖掘CHS的cDNA全长及其编码区,利用生物信息学方法对该基因蛋白的特征和功能进行分析,运用ClustalX1.83和MEGA4.0软件进行同源性比对和系统进化树构建,采用实时荧光定量PCR(qPCR)分析CHS在高良姜不同组织中的表达差异.结果 高良姜CHS编码区为1173 bp,编码391个氨基酸.其编码蛋白是分子量为94.5 kDa的亲水性蛋白,不合有信号肽、转运肽、靶肽和跨膜结构域,具有CHS保守功能域并归属于CHS超级家族.CHS在高良姜不同组织中的表达模式为:根茎＞茎＞叶.结论 成功获得高良姜CHS序列,并分析其特征和表达模式,可为高良姜黄酮类有效成分的生物合成研究提供参考.
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