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目的：对胃肠道间质肿瘤的临床病理形态进行研究并观察，分析其特点。方法对我院自2012年3月-2013年2月收治的60例病患资料进行分析，并应用巨检以及镜检、免疫组化染色等方法进行病理形态的结果验证。结果按照组织学分型可见、胃部以及肠道部位是胃肠道间质瘤分布较为广泛的部位，标记为CD117阳性率为93.33％，标记为CD34阳性率为75％，标记为SMA的阳性率为50％，标记为S-100阳性率为20％。结论应用免疫组织化学染色方法对胃肠道间质肿瘤临床病理形态进行观察分析具有良好的应用效果，是临床参考的有效实践