A型口蹄疫病毒(FMDV)VP1基因遗传进化分析

来源 :四川大学学报（自然科学版） | 被引量 : 0次 | 上传用户：cqwzhy1990

【摘要】

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对疑似感染FMDV的样本进行了FMDV VP1基因RT-PCR鉴定,测定了其中1个阳性样本序列(命名为HY).采用生物信息学软件比较了HY与参考序列的同源性,并构建VP1基因的分子系统树.结果

【作者】

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杨江范辰韵高文倩罗晓林安添午庞倩许路来徐岳松

【机构】

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四川大学生命科学学院,动物疫病与食品安全四川省重点实验室,生物资源与生态环境教育部重点实验室,“985工程”西南资源环境与灾害防治科技创新平台,成都610064四川省草原科学研究院,成都,611731

【出处】

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四川大学学报（自然科学版）

【发表日期】

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2016年2期

【关键词】

：

口蹄疫病毒 VP1 A型进化树分析

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对疑似感染FMDV的样本进行了FMDV VP1基因RT-PCR鉴定,测定了其中1个阳性样本序列(命名为HY).采用生物信息学软件比较了HY与参考序列的同源性,并构建VP1基因的分子系统树.结果表明:HY属A型FMDV亚洲拓扑型东南亚-97谱系,与我国近年来报道的A/GDMM/CHA/2013的序列相似性为99.1％,与AF/72疫苗株的相似性仅为79.0％.提示我国近年来报道的A型毒株与AF/72疫苗株的序列差异较大,应及时更换A型口蹄疫疫苗毒株.

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