免疫组库测序分析新生儿脓毒症患者外周血T细胞受体β链CDR3的多样性

来源 :中国当代儿科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sam8899138
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目的 采用免疫组库测序的方法分析新生儿脓毒症患者外周血T细胞受体(T cell receptor,TCR)β链互补决定区3(complementarity determining region 3,CDR3)的多样性,探讨新生儿脓毒症的可能发病机制.方法 12例新生儿脓毒症确诊患儿为病例组,9例胎龄、出生体重及日龄相匹配的健康足月儿为对照组.采用Omega公司核酸纯化试剂盒(SQ Blood DNA KitⅡ)从外周血样品中提取DNA,对TCRβ链CDR3进行多重PCR扩增,然后对产物进行高通量测序,分析其TCRβ链CDR3多样性及表达的差异.结果 病例组和对照组的TCRβ链CDR3长度和类型相似,且均呈高斯分布.采用D50和香农-威纳指数作为多样性的评价指标,显示病例组TCRβ链CDR3多样性低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).针对TCRβ链V片段48个基因的使用频率进行比较,其中TRBV10-3、TRBV2和TRBV20-1的使用频率病例组高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);对TCRβ链J片段13个基因的使用频率进行比较,其中TRBJ2-3、TRBJ2-5和TRBJ2-7的使用频率病例组高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).结论 新生儿脓毒症患者外周血TCRβ链CDR3多样性发生了明显改变,提示这可能与新生儿脓毒症的免疫发病机制有关.
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