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生物肥料可以作基肥、追肥,可沟施或穴施,也可用来拌种、浸种、蘸根或叶面喷施,具体因菌肥类型而异。1农用菌型农用菌型微生物肥料的科学施用方法较多,主要有：一是用2 kg固态菌剂与40～60 kg腐熟有机肥混合均匀后作基肥、追肥或育苗；二是将固态菌剂与营养土掺匀制作营养钵；三是与稀泥浆混拌，在苗木移栽前蘸根；四是播前将种子浸入10～20倍菌剂稀释液或用稀释液喷湿，使种子与液态生物菌剂充分接触后再播种；